2017年1月，为更好贯彻落实《中共中央、国务院关于加强和改进新形势下高校思想政治工作的意见》（中发[2016]31号）文件精神，进一步加强学校思想政治理论课建设和学校思想政治教育工作，学校成立马克思主义学院。

马克思主义学院下设思想政治教育、中国近现代史、马克思主义基本原理、马克思主义中国化、习近平新时代中国特色社会主义思想概论、形势与政策6个教研室，承担全校本科生6门课程、研究生3门课程的教学工作。

学院坚持“马院姓马、在马言马”的鲜明导向，围绕学校都市农林特色高水平应用型大学办学定位和培养目标，把思政课教学作为学院基本职责，充分发挥思政课是立德树人关键课程的作用，聚焦全面推动习近平新时代中国特色社会主义思想进教材进课堂进学生头脑，打造“首善标准红色基因北农特色”的思政金课，不断提升思政课的思想性、理论性和亲和力、针对性。在校党委坚强领导下，围绕办好立德树人关键课程，深入推进党的创新理论“三进”，开好讲好《习近平新时代中国特色社会主义思想在京华大地生动实践》；完善思政课“四级评价体系”，守住思政课堂主阵地，推动思政课“红”的底色与农业院校“绿”的特色深度融合，思政课教师在理论阐释、建言献策、讲述育人故事、指导学生社团、参与中央部门重要工作等方面取得了一系列特色成果，相关工作被人民网、光明网、中国教育报专题报道，相关成果被纳入北京高校党建思政工作培育项目。思政课教师指导学生参加全国高校大学生讲思政课公开课竞赛，荣获北京赛区一等奖2项、全国三等奖1项。思政课教师牵头申报的教学课例《建设美丽中国》在“永远跟党走”大中小学思政课优秀教学课例征集展示活动中荣获一等奖，在第四届北京农学院教师教学创新大赛中荣获一等奖，《从“心”出发，把思政课打造成为“实证”课》案例荣获北京市大中小幼讲述育人故事二等奖，《依托自媒体开展思政课教学》论文在全国农林院校思政课教学年会荣获一等奖。思政课教师指导创作的作品荣获2023年全国青少年最佳模拟政协提案，相关政策建议得到市领导批示，被纳入《市长参阅》。新思想教学团队讲授的新思想概论课荣获北京市第四届教学创新大赛一等奖。马院荣获2017-2021年度北京高校德育工作先进集体和北京农学院“三育人”先进集体荣誉称号。《打造“红色基因、首善标准、北农特色”思政金课》获批北京高校党建思政培育项目，被推荐申报北京高校思政课改革创新优秀案例。

学院现有教职工24人，其中一线专职教师22名，行政管理2名。教师队伍中教授1人、副教授15人，博士学位7人。学院先后获批3个校级教学团队，教师队伍中获聘北京高校思政课特级教授1人、2名教师分别荣获北京高校思想政治理论课青年教师教学基本功比赛一等奖、二等奖、三等奖，1名教师荣获北京市师德先锋称号，1名教师荣获北京高校德育先进工作者称号，1名教师荣获北京高校优秀党务工作者和北京市管理育人先锋，入选北京高校青年英才计划1人。